Xuyến bị bắt trong khi đang lẩn trốn tại Tây Ninh.
Vào tháng 6.2007 tại cảng Cát Lái (TP.HCM), Cục Điều tra chống buôn lậu Tổng cục Hải quan và Cục Hải quan TP.HCM kiểm tra 10 container hàng xơ dừa (theo tờ khai của Công ty TNHH thương mại - dịch vụ Nam Nguyên, trụ sở tại đường Nguyễn Kiệm, P.4, Q.Phú Nhuận, TP.HCM) nhưng không thấy xơ dừa mà toàn là gỗ trắc, cẩm lai, trị giá khoảng 15 tỉ đồng, không có chứng từ chứng minh nguồn gốc xuất xứ. Mạc Văn Nguyện - Giám đốc Công ty Nam Nguyên, khai hàng trong container là của Châu Minh Xuyến gửi nhờ làm thủ tục xuất khẩu.
Công an đã khởi tố vụ án, khởi tố bị can đối với Nguyện và Xuyến, nhưng Xuyến đã trốn khỏi nơi cư trú.