Tuy nhiên, do tuỳ tiện, thiếu quy hoạch, tình trạng ô nhiễm môi trường biển và gây mất cảnh quan đang ở mức báo động, ảnh hưởng nghiêm trọng đến danh tiếng của Khu dự trữ sinh quyển thế giới.

Theo ông Vũ Tiến Bảy, Trưởng phòng Văn hoá - Thông tin huyện Cát Hải: Vịnh Cát Bà là địa điểm du lịch nổi tiếng, hấp dẫn du khách. Do không gian có hạn nên chỉ có thể bố trí khoảng 150 bè cá, song hiện nay số bè cá tại đây đã tăng đột biến, lên đến hơn 500 bè các loại gây ra tình trạng quá tải.

Việc các hộ dân tuỳ tiện cắm sào, quây lưới để tạo lồng nuôi cá làm ảnh hưởng xấu, gây mất cảnh quan du lịch, đồng thời cản trở giao thông, tăng nguy cơ mất an toàn đường thuỷ.

Mặt khác, đại đa số người dân không có ý thức giữ gìn, bảo vệ môi trường biển, tuỳ tiện xả rác, thức ăn ôi thiu xuống biển làm cho mức độ ô nhiễm của khu vực này ngày càng tăng.