Đáng nói là dự án thoát nước vệ sinh môi trường, với nguồn vốn vay 45 triệu USD của Ngân hàng Thế giới vừa hoàn tất là nguyên nhân chính gây ô nhiễm môi trường. Quy hoạch bất hợp lý của dự án thoát nước vệ sinh môi trường Đà Nẵng là mở các cửa xả cống nước thải trực tiếp ra các bãi biển, khiến cho dải bờ biển gần 20km thuộc quận Sơn Trà-Ngũ Hành Sơn bị ô nhiễm nghiêm trọng. Hơn 10km bờ biển dọc đường Nguyễn Tất Thành - vịnh Đà Nẵng cũng chung thực trạng trên.
Đặc biệt, cửa xả cống nước thải tại phường Thanh Bình và cửa sông Phú Lộc đã gây bức xúc cho người dân trong khu vực vì nạn ô nhiễm, mặc dù hạng mục thu gom và xử lý nước thải này được đầu tư 8,12 triệu USD và vừa đưa vào vận hành từ tháng 6.2007.
Trả lời chất vấn đại biểu HĐND, cả GĐ Sở Tài nguyên - Môi trường Nguyễn Điểu, GĐ Sở GTVT Đặng Việt Dũng đều "chống chế" rằng, dự án mới vận hành thử nghiệm, hệ thống thu gom nước thải chưa đấu nối được với cống cũ..., nên chưa giải quyết triệt để vấn đề ô nhiễm.