Tuy nhiên, đến nay đơn vị này vẫn chưa có Ban GĐ. Toàn PTN chỉ có 5 cán bộ kiêm nhiệm và 10 cộng tác viên.

Theo PGS-TS Vũ Đức Minh thì nguyên nhân của tình trạng trên là do PTN chưa có quy chế hoạt động, chưa có biên chế chính thức và kinh phí hoạt động.

Nếu như xâu chuỗi "vấn đề PTNTĐ" thì quả là có quá nhiều bất cập. Ngay từ năm 2001, để có được "mũi nhọn" trong khoa học, Thủ tướng cho phép thành lập 19 PTNTĐ với tổng đầu tư khoảng 1.125 tỉ đồng. Phải tận đến năm 2004 thì mới chỉ có 2 PTNTĐ hoàn thành; đến năm 2005 có 3 PTNTĐ hoàn thành và đến năm 2005 thêm 5 PTNTĐ được hoàn thành...

Cùng với "tốc độ rùa" về xây dựng; vấn đề ban hành cơ chế điều hành, sử dụng, nghiên cứu trọng điểm cũng "bò chậm" không kém. Trên thực tế không chỉ có PTNTĐ enzyme-protein, mà hầu hết những PTNTĐ với con số đầu tư hàng ngàn tỉ đồng nêu trên vẫn đang bị lãng phí vì... thiếu cơ chế hoạt động.

Theo các nhà khoa học, cái khó về cơ chế đang bó buộc hoạt động nghiên cứu, sáng tạo và ứng dụng. Như vậy đã có ít nhất cả nửa thập kỷ trôi qua, "mũi nhọn" khoa học công nghệ vẫn chưa được mài sắc; trong khi yếu tố "trọng điểm" lại đang bị coi nhẹ. Đã có nhà khoa học thốt lên rằng: Hai chữ "cơ chế" thật cay đắng!