Theo đánh giá của ngành tài nguyên và môi trường, do buông lỏng công tác giám sát và kiểm tra nguồn xả thải, nên thời gian qua chất lượng môi trường tại TP Hồ Chí Minh suy giảm nghiêm trọng. Ô nhiễm khu vực nội thành chỉ được khắc phục một phần trong lúc khu vực ngoại thành lại đối mặt với nguy cơ ô nhiễm mới từ các khu-cụm công nghiệp thiếu hệ thống xử lý nước thải.

Nguồn rác thải 6.000 tấn/ngày vẫn chưa được xử lý tốt, nhiều bãi rác bốc mùi hôi, tràn nước rỉ rác gây ảnh hưởng đến cuộc sống của người dân. Một số chương trình phân loại rác tại nguồn hiệu quả thấp vì chưa có cơ chế đồng bộ.

Hệ thống kênh rạch ô nhiễm nghiêm trọng trong khi đó chế tài xử lý các doanh nghiệp còn thiếu nên ở một số quận, huyện cán bộ lúng túng trong thực hiện.

Đề xuất hướng xử lý, ông Đào Anh Kiệt, Giám đốc Sở Tài nguyên và Môi trường khẳng định: Trong thời gian tới sẽ phối hợp với 24 quận, huyện trên cơ sở hỗ trợ của lực lượng Cảnh sát môi trường tăng cường công tác kiểm tra chất lượng xả thải tại các khu công nghiệp, khu dân cư, các cơ sở sản xuất nhỏ. Nếu đơn vị nào vi phạm sẽ bị xử lý nghiêm theo Luật Bảo vệ môi trường.

Mặt khác, Sở Tài nguyên và Môi trường cũng kiến nghị UBND TP Hồ Chí Minh không xem xét cấp phép cho các dự án đầu tư dễ gây ô nhiễm. Ngay trong năm 2008, tất cả các "lỗ hổng" về chế tài xử lý các doanh nghiệp gây ô nhiễm và tái phạm nhiều lần sẽ được bổ sung để Phòng Tài nguyên và Môi trường 24 quận, huyện có đủ cơ sở xử phạt các đơn vị đang gây ô nhiễm trên địa bàn.