Là cầu thủ Việt Nam ghi nhiều bàn thắng nhất tại V-League 2006, với 10 lần sút tung lưới đối phương, là tác giả của bàn thắng đầu tiên sau 40 năm bóng đá Việt Nam có mặt tại sân chơi ASIAD. Đóng góp một phần quan trọng vào lối chơi của các đội bóng tham gia, Công Vinh, thủ quân của đội U23 Việt Nam tại SEA Games 24 tới, đang đứng trước cơ hội giành danh hiệu cao quý nhất trong năm - Quả bóng vàng Việt Nam 2006. Tuy vậy, với Công Vinh, đằng sau một năm tưởng chừng như thành công đó, vẫn còn nhiều băn khoăn và bức xúc.
Năm 2006 có thể nói đã mang đến cho Lê Công Vinh rất nhiều thành tựu đáng kể. Trở về từ SEA Games 23, nhất là khi cầu thủ đàn anh Văn Quyến bị "cấm hành nghề bóng đá" sau khi dính đến tiêu cực, Công Vinh càng toả sáng và trở nên quan trọng, không chỉ với SLNA mà còn với cả ĐTQG Việt Nam.
Không làm người hâm mộ, ban lãnh đạo và các đồng đội thất vọng, Công Vinh thi đấu rất nổi bật và trở thành Vua phá lưới nội tại V-League 2006, với 10 bàn thắng. Đặc biệt hơn, tại ASIAD 15, anh cũng là tác giả bàn thắng đầu tiên cho Việt Nam tại một kỳ ASIAD kể từ năm 1966. Nhưng điều quan trọng nhất chính là vai trò không thể thiếu của tiền đạo này, trong màu áo của cả SLNA lẫn ĐTQG Việt Nam. Hiện tại, Lê Công Vinh đang là thủ quân của đội U23 và đảm trách vai trò tiền đạo lùi trong sơ đồ chiến thuật 4-5-1 của HLV Mai Đức Chung.
Tuy nhiên, năm 2006 cũng để lại nhiều thất vọng, buồn chán cho Công Vinh, thậm chí, rất nhiều lần Công Vinh muốn từ giã ĐTQG. Đầu năm 2006, khi mà một tờ báo thể thao đăng tải thông tin không chính xác là Công Vinh đã tố cáo Văn Quyến bán độ, chỉ để giành một vị trí quan trọng trong đội. "Kể từ hôm đó cho tới mấy hôm sau, tôi như một thằng điên loạn. Không hiểu, tại sao người ta lại gán cho tôi cái điều xấu xa đến thế. Nếu tố cáo tiêu cực, cũng không phải để trục lợi cho mình.
Bạn bè, anh em, gia đình, đồng đội và rất nhiều người hâm mộ gọi điện, nhắn tin hỏi như thế nào. Thậm chí, người người còn chửi tôi đê tiện. Không chịu đựng nổi, tôi yêu cầu tờ báo đó phải đính chính. Dù sau này, họ có làm nhưng những gì đã nói, những gì đã nghe đều không thể lấy lại được. Đó là khoảng thời gian khó khăn nhất của tôi" - Công Vinh nói với giọng vẫn đầy bức bối.
Nỗi thất vọng vắt sang tận AFF Cup. Trong một giải đấu mà đội tuyển Việt Nam thi đấu cũng chẳng đến mức quá tệ nhưng lại gặp khó khăn ở khâu ghi bàn. Và khi Công Vinh cầm bóng đột phá để tìm kiếm bàn thắng thì lại bị gán là "chơi cá nhân"... và bao nhiêu tin đồn thất thiệt khác. Vinh tâm sự: "Tôi không thể nào chịu được tại sao người ta có thể chụp mũ như thế, làm cả tôi cả Phan Thanh Bình đều rất khó xử.
Ngoài đời, chúng tôi vẫn là những người bạn tốt chứ có gì rạn nứt đâu? Còn ở trên sân, khi mình cầm bóng đột phá mà ghi bàn, người ta khen là quyết đoán, đẳng cấp. Nhưng chẳng may, mình cầm bóng mà không ghi được bàn thắng, họ lại bảo mình có vấn đề, không muốn cho đồng đội ghi bàn. Nhiều lúc, tôi cảm thấy chán nản vô cùng và trong những lúc đó, ý tưởng từ giã đội tuyển lại loé lên trong đầu".
Một quan chức của Phòng Các ĐTQG và đào tạo trẻ thuộc Liên đoàn Bóng đá Việt Nam rất lo lắng: "Chúng tôi biết áp lực rất lớn lên Vinh và cậu ấy, đôi lúc vì cảm thấy mệt mỏi mà muốn buông xuôi. Tôi rất lo lắng nếu cầu thủ này quyết định từ giã ĐTQG giống như trung vệ Huy Hoàng. Chúng ta phải có một liệu pháp tâm lý thật tốt để xả stress cho các cầu thủ. Công Vinh đang là cầu thủ quan trọng nhất của đội U23 Việt Nam cũng như ĐTQG, đó là sự thật. Không phải ai cũng có những danh hiệu, kinh nghiệm trận mạc và cả ý thức nghề nghiệp tốt như Công Vinh ở lứa tuổi của cậu ấy. Công Vinh là niềm hy vọng của bóng đá Việt Nam tại SEA Games 24".