Trong đó, 48 cơ sở giết mổ gia súc hoạt động ngay trong các khu dân cư, đặc biệt là 12 cơ sở thuộc phường Phước Hải.

Tình trạng ô nhiễm quá mức khiến nhiều người dân phản ứng gay gắt, gửi đơn thư kiến nghị đến các cơ quan chức năng phản ánh một số cơ sở gây ô nhiễm như: Công ty TNHH thuỷ sản Hồng Phát, 12 cơ sở giết mổ lợn ở phường Phước Hải, 11 cơ sở chăn nuôi lợn ở phường Vĩnh Hoà...

Mặc dù từ năm 1999, tỉnh Khánh Hoà đã có kế hoạch xây dựng cho thành phố Nha Trang một khu giết mổ gia súc tập trung, nhưng đến thời điểm này dự án vẫn chưa triển khai được do không tìm được mặt bằng và địa điểm thích hợp.

Đồng thời, Dự án cơ sở hạ tầng khu dịch vụ hậu cần nghề cá Bắc Hòn Ông tại xã Phước Đồng có tổng mức đầu tư 166 tỷ đồng, được UBND tỉnh Khánh Hoà phê duyệt từ năm 2001, nhằm di dời các cơ sở chế biến thuỷ sản gây ô nhiễm trong nội thị về đây, nhưng tiến độ thực hiện quá chậm, hiện chỉ mới đầu tư 15 tỷ đồng cho công tác giải phòng mặt bằng và sản ủi, xây dựng bước đầu.

Bên cạnh đó, Nha Trang hiện còn 3 cơ sở sản xuất công nghiệp, kinh doanh được xác định thuộc loại gây ô nhiễm nghiêm trọng, phải được xử lý dứt điểm (di dời) trong giai đoạn 2003- 2005 theo Quyết định 64/ 2003/QĐ-TTg của Thủ tướng Chính phủ; bao gồm: nhà máy điện Chụt, Bãi kinh doanh than Bình Tân và Bãi rác thải phía bắc thành phố. Nhưng cho đến nay, vì các lý do, số cơ sở này vẫn hoạt động và tiếp tục gây ô nhiễm nghiêm trọng môi trường thành phố.

Theo đánh giá của Hội đồng nhân dân tỉnh Khánh Hoà: Nha Trang hiện có trên 4.000 cơ sở sản xuất được cấp phép kinh doanh, trong đó có nhiều cơ sở được hình thành từ khá lâu, khi đó dân cư còn thưa thớt. Nay với tốc độ phát triển đô thị khá nhanh, nên nhiều cơ sở sản xuất nghiễm nhiên tồn tại giữa các khu dân cư đông đúc, ô nhiễm môi trường đã ảnh hưởng trực tiếp đến đời sống người dân thành phố.