Nhiều học sinh do thầy dạy, nay đã là tiến sĩ, thạc sĩ. Đặc biệt, khoá học 1991 - 1992, lớp học do thầy phụ trách đã có 43/50 học sinh thi đỗ đại học.  Năm 1992, thầy Phùng được ngành giáo dục đề bạt giữ chức vụ Phó Hiệu trưởng Trường THPT Ba Đình, phụ trách chuyên môn.

Nhiều sáng kiến, kinh nghiệm của thầy đã được ngành giáo dục đánh giá cao, như: "Phương trình đường tròn và ứng dụng", "Sử dụng phương pháp hàm số trong giải phương trình" (được xếp loại B cấp tỉnh); "Hướng dẫn HS giải bài tập toán học theo phương pháp dạy học phát hiện và giải quyết vấn đề", "Vận dụng phép duy vật biện chứng trong dạy toán" (đạt loại A cấp tỉnh).

Từ tháng 1.2000 đến nay, với cương vị là Hiệu trưởng, thầy luôn tìm tòi, định hướng hoạt động của trường sao cho phù hợp với tình hình thực tế. Hàng năm, Trường THPT Ba Đình có hàng trăm HS giỏi cấp tỉnh, nhiều HS giỏi cấp quốc gia và thi đỗ vào các trường ĐH.

Từ 2001- 2005, thầy Phùng được Chủ tịch UBND tỉnh, Bộ trưởng Bộ GDĐT tặng nhiều bằng khen. Năm 2003, thầy vinh dự được Thủ tướng tặng bằng khen, năm 2005 đạt danh hiệu Chiến sĩ thi đua toàn quốc.